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Publications

BOOKS and Chapters of collective books.

1991. A-P. Carnat, J. Gueugnot, P. Coquillard, S.Aulagnier. La plante et le matériel végétal : description, définition. Encyclopédie des Médecines Naturelles (ouvr. Coll.) « Aromathérapie et Phytothérapie ». B-2 pp : 1-72, Editions Techniques, Paris.

1997. P. Coquillard & D. R. C. Hill. Modélisation et Simulation d’Ecosystèmes : des modèles déterministes aux simulations à événements discrets. Collection « Recherche en Ecologie », 273 pages, Masson Ed., Paris. 

2007. D. R. c. Hill & P. Coquillard. Ecological Modeling and Simulation : From historical developments to individual-based modelling. Handbook of Dynamic System Modelling. Paul A. Fishwick Ed., Chapman & Hall/CRC Pub.,  computer & information sciences series, 29-1 à 29-15 Gainesville, USA.

2010. P. Coquillard, A. Muzy, E. Wajnberg. Activatability for simulation tractability of NP problems: Application to Ecology. Complex Systems: Activity-Based Modeling and Simulation, Cargese Interdisciplinary Seminar, Corsica, A. Muzy, D. Hill and B.P. Zeigler editors, 2009. Pdf


International Publications


2017.
Massardier-Galatà L, Morinay J, Bailleul F, Wajnberg E, Guinet C, Coquillard P.  Breeding success of a marine central place forager in the context of climate change: A modeling approach. PLoS ONE

2013. Wajnberg E.,  Hoffmeister T.E., Coquillard  P. Optimal within-patch movement strategies for optimising patch residence time: an agent-based modelling approach. Behavioural Ecology & Sociobiology, 67(12):2053-2063. PDF
 
2013.
Alexandre Muzy, Franck Varenne, Bernard P. Zeigler, Jonathan Caux, Patrick Coquillard, Luc Touraille, Dominique Prunetti, Philippe Caillou, Olivier Michel, David RC Hill. Refounding of Activity Concept? Towards a Federative Paradigm for Modelling and SimulationSimulation, vol. 89, no. 2, 156-177. PDF

2012. Wajnberg E, Coquillard P, Vet LEM, Hoffmeister T. Optimal Resource Allocation to Survival and Reproduction in Parasitic Wasps Foraging in Fragmented Habitats. PLoS ONE 7(6): e38227. PDF

2012. Jaouannet M, Perfus-Barbeoch L, Deleury E, Magliano M, Engler G, Vieira P, Danchin E. GJ, Da Rocha M, Coquillard P, Abad P, Rosso M-N. A root-knot nematode-secreted protein is injected into giant cells and targeted to the nuclei. New Phytologist (2012) 194: 924–931.

2012.
COQUILLARD P., MUZY A, DIENER F. Optimal phenotypic plasticity in a stochastic environment minimizes the cost/benefit ratio. Ecological Modelling 242: 28–36.  PDF - Suppl-Data.

2009. G. DAUPHIN, P COQUILLARD, S. COLAZZA, E. PERI, É. WAJNBERG, 2008. Host kairomone learning and foraging success in an egg parasitoid: a simulation model. Ecological Entomology 34(2):193-203.PDF

2008. A. MUZY, J.J. NUTARO, B.P. ZEIGLER, P. COQUILLARD, 2008. Modeling and simulation of fire spreading through the activity tracking paradigm. Ecological modeling 219(1-2):212-225. PDF

2006. Prevosto B., Dambrine E., Robert A., Coquillard P., 2006. Broom (Cytisus scoparius) colonization after grazing abandonment in the French Massif Central: impact on vegetation composition and resource availability. Acta Oecologica, 30:258-268.PDF

2004. THIBAUT T., MEINESZ A., COQUILLARD P., 2004.Biomass seasonality of Caulerpa taxifolia in the Mediterranean sea. Aquatic Botany, 80: 291-297.PDF

2004. PREVOSTO B., ROBERT A., COQUILLARD P., 2004. Development of Cytisus Scoparius L. at stand and individual level in a mid-elevation mountain of the French Massif Central. Acta Oecologica, 25: 73-81. PDF

2003. PREVOSTO B., HILL D.R.C., COQUILLARD P., 2003. Individual-based modelling of Pinus sylvestris invasion after grazing abandonment in the French Massif Central. Plant Ecology, 166 (1):121 -137.PDF

2002. HILL D., THIBAUT T., COQUILLARD P., 2002. Predicting invasive species expansion using GIS and simulation coupling. Simulation, SIMUL-T SOC MOD SIM 1(1):30-35.
        
2001. HILL D., COQUILLARD P., AUSSEM A., VAUGELAS J. de, THIBAUT T., MEINESZ A., 2001.  Modeling the ultimate seaweed expansion. Simulation, SIMUL-T SOC MOD SIM :76(2):126-134.

2000. PREVOSTO B., CURT T., GUEUGNOT J., COQUILLARD P., 2000. Modelling mid-elevation Scots pine growth on volcanic substrate. Forest Ecology & Management. 131:223-237.PDF

2000. COQUILLARD P., THIBAUT T., HILL D.R., GUEUGNOT J., MAZEL C., COQUILLARD, Y., 2000. Simulation of the mollusc Ascoglossa Elysia subornata population dynamics: application to the potential biocontrol of Caulerpa taxifolia growth in the Mediterranean Sea. Ecological Modelling, 135 :1-16. PDF

2000. COQUILLARD P., GUEUGNOT J., MICHALET R., CARNAT A.-P,  L'Homme G. 2000 Heathland functioning in a perspective of climate warming : estimation of parameters, elements for discrete event simulation. Plant Ecology, 149:107-118.PDF

1999. PREVOSTO B., COQUILLARD P., GUEUGNOT J., 1999. Growth models of silver birch (Betula pendula Roth.) on two volcanic mountains in the French Massif Central. Plant Ecology, 144(2), 231-242.PDF

1998. Hill D., Coquillard P., Vaugelas J. de, Meinesz A., 1998. An algorithmic model for invasive species: Application to Caulerpa taxifolia (Vahl) C. Agardh development in the North-Western Mediterranean Sea. Ecological modelling (109):251-265. PDF

1997. Hill, D., Coquillard, P., de Vaugelas, J., 1997. Discrete-event simulation of alga expansion. Simulation, SIMUL-T SOC MOD SIM 68 (5):269-277.

1996. Coquillard P., Hill D.R.C., 1996. Oriented-object simulation of Scots Pine growth interactions. Simulation, SIMUL-T SOC MOD SIM (Mac Leod simulation in the service of society):65(6)411-416.

1995. Coquillard P., 1995. Simulation  of  the  cyclical  process  of heathlands:  induction  of  mosaic  structures,  evolution  to  irreversible  states. Ecological modelling (80):97-111. PDF

1991. Coquillard P., Gueugnot J., 1991. Regressive dynamics and denudation process of vegetation on volcanoes in the « Chaîne des Puys » (French Massif Central): assay of interpretation. Plant Ecology (anciennement Vegetatio), 93:131-141.PDF


International Conferences in Computer Science

Coquillard P. (Invited speaker), 2009. Activatability for simulation tractability of NP problems: Application to Ecology. Cargese Interdisciplinary Seminar 2009. April 20-24th, Cargèse, France.

Robert A., Prévosto B., Hill D.R.C., Coquillard P. 2005. Modelling the colonisation dynamics of Scots Pine in French areas. Impact of possible atmospheric carbon change. First Open Intern. Conf. Modeling & Simulation (OICMS), Clermont-Ferrand, June 12-15, Blaise Pascal, Univ. (Eds), pp: 231-239. France.

Robert A., Prevosto B., Hill D. Coquillard P. 2004. Modelling of the colonization of Scots Pine in French areas at mid-elevation. Impact of environmental changes (climatic conditions and atmospheric CO2 concentrations). Joint Conference MPD7-DeStoBio 3. Computational and Mathematical Population Dynamics. Trento (It.) june 21-25, p. 70.

Robert A., Prevosto B., Coquillard P. 2003. Improving the biological realism in an individual-based model simulating the forest colonisation at landscape scale : application to a data set from Scots pine trees. International Conference on Mathematical Biology, Dundee, 6-9 august, 2003, p. 112.

 HILL D., COQUILLARD P., GARCIA B., TRAORE M.K., MAZEL C., CAMPOS A. T. THIBAULT, "Multimodeling and Object-oriented Design Patterns Application to Bio-control Simulation", Proceedings of Artificial Intelligence and Simulation 2000, Arizona, march 2000, pp. 219-228, 2000.

Hill  D., COQUILLARD P., Mazel C. Interprétation des résultats de couplage de systèmes d’information géographiques et d’outil de simulation discrète d’écosystèmes par analyse spectrale. Europ. Conf. Technologies de l’Information pour l’Environnement. W. Geiger, A. Jaesche, O. Rentz, E. Simon, TH. Spengler, L. Zillox, T. Zundel (Hrgs. Eds), Metropolis Verlag, Marburg 1997.

HILL D., MAZEL C., COQUILLARD P., "Integrating V&V in the object-oriented life cycle of ecological modelling simulation projects". 8th SCS European Simulation Symposium, Oct. 24-26, Genova, Italy, Volume II pp. 21-25, 1996.

HILL D., MAZEL C., COQUILLARD P., Gueugnot J. Object-Oriented modelling for forest growth simulation environments. Proc. Object Technol. 95 Conference : 5 pages, March 1995, Oxford (U.K)

HILL D., COQUILLARD P., VAUVELAS J. MEINESZ A., "A stochastic model with spatial constraints", EUROSIM Congress, September 11-15, Vienna, Austria, pp. 999-1004, 1995.

HILL D., PASTRE J., COQUILLARD P., GUEUGNOT J., "Design of an Ecosystem Modelling Environment: Application to Forest Growth Simulation", CISS 94, Joint Simulation Societies, Zurich, Switzerland, August 22-26, pp. 538-544, 1994.

Others International Conferences

Hoffmeister T.S., L.E.M. Vet, P. Coquillard & E. Wajnberg, 2008. Life-history evolution in a changing world. European Ecology Congress – Gfoe “Biodiversity in an Ecosystem Context”, Leipzig, Germany, September

Hoffmeister T.S., L.E.M. Vet, P. Coquillard & E. Wajnberg, 2008. Life-history evolution in a changing world. Bepar workshop on Adaptive Dynamics, Rennes, France, June.

Coquillard P., 2007. Elements for individual based modelling of Epinephelus marginatus in the Mediterranean Sea. 2nd Symposium on Mediterranean Groupers. Francour P., Gratiot J. (eds). Nice, May 10th – 13th.
 
Prevosto B., CURT T., Dambrine E., Coquillard P., 2003. Natural tree colonization in French Massif Central according to past land-uses : impact on stand structure, soils and vegetation, IUFRO symposium 'History and forest Biodiversity' .

THIBAUT T., HILL D.R.C., COQUILLARD P., 2000. The need for modelling in the management of an invasive species; the case of Caulerpa taxifolia in the Mediterranean Sea. American Society of Limnology and Oceanography (ASLO 2000). Aquatic Sciences Meeting. June 5-9, 2000, Copenhagen, Denmark. Poster.

PREVOSTO B. COQUILLARD P., GUEUGNOT J., HILL D., "Modeling of Sylver birch growth at mountain level on volcanic soils. Second International Workshop on Functional-Structural Tree Models, INRA (Eds), Clermont-Ferrand, 95 p, 1999.

COQUILLARD P., HILL D. R. C., VAUGELAS J. de, MEINESZ A. 1999. "Modelling & simulating Caulerpa taxifolia (Vahl) C. agardh in the north-western mediterranean sea : results ansd perpectives", United Nations European Program proceedings of the workshop on Invasive Caulerpa species in the Mediterranean, Heraklion, Crete (Greece), 18-20 march 1998. MTS; 125, UNEP Athens, pp. 159-175.

VAUGELAS de J., MEINESZ A., COQUILLARD P., HILL D., "Modéliser Caulerpa taxifolia pour prévoir sa distribution et simuler les opérations d'éradication locale", Third International Workshop on Caulerpa taxifolia, Boudouresque C.-F., Meinesz A.,et Gravez V. edit, Publ. Universitat Barcelona, pp. 63-67, 1999.

HILL D., COQUILLARD P., VAUVELAS J. MEINEZ A., "Simulation sur ordinateur de l'expansion de l'algue Tropicale Caulerpa taxifolia en Méditerranée, Résultats préliminaires", 2nd International Conference on Caulerpa Taxifolia, Dec. 11-15, Barcelone, pp. 119-127, 1994.

Michelin Y., Coquillard P., Hill D., L’Homme, G., Loiseau P., Micol D. Sustainable herbivores production and ecological land use in mountains areas: a multidisciplinary approach. IV Intern. Sympos. Nutrition Herbivorous., Clermont-Ferrand, 11-15 sep. 1995 (poster com).

Coquillard P. & Fain J. Montecarlos’ simulation of colonization by Pinus sylvestris of heathland on degenerate phase on volcanic substrate. Functionning and dynamics of natural and perturbed ecosystems. In D. Bellan-Santini et al (Eds), Lavoisier Pub. pp: 274-289, Paris.1995


National Publications & Conferences 

PREVOSTO B., CURT T., DAMBRINE E., COQUILLARD P., 2004. Natural tree colonization of former agricultural lands in the French Massif Central: Impact of past land use on stand structure, soil characteristics and understorey vegetation. In O. Honnay, K. Verheyen, B. Bossuyt, M. Hermy (eds), « Forest Biodiversity:
Lessons from History Conservation ». CABI publishing, IUFRO Research Series 10, p 41-53.

PREVOSTO B., COQUILLARD P., 2001. Dynamique des boisements spontanés dans la Chaîne des Puys : une approche par la modélisation. Forêt méditerranéenne, XXII (1): 29-36.

Hill D., Mechoud S., Campos S., Coquillard P., Gueugnot J., Orth D., Michelin Y., Poix C., L’Homme G., Carrere P., Lafarage M., Loiseau P. Micol D., Brun J-P., Decuq F., Dumont B., Petit M., Teuma M., 2000. Modélisation de l’entretien du paysage par des herbivores en moyenne montagne : une approche multi-agents. Ingénieries 21 : 63-75. PDF

Vaugelas J. de, Meinesz A., Coquillard P., Hill D., 1997. A computer simulation to evaluate the impact of Caulerpa taxifolia on Mediterranean biodiversity. Vie et Milieu 47(4): 397-400.
        
Coquillard P., Gueugnot J., Julve P., Michalet R., Michelin Y., 1994. Carte écologique du Massif du Sancy au 1/25000. Carte et notice. Ecologia Mediterranea XX(1/2) :9-57.PDF

Gueugnot J., Coquillard P., Michelin Y., Jougla P., 1993. Agro-écologie des landes et herbages de l’étage montagnard du Massif du Sancy (Massif Central). Ecologie 24(2-3) :151-156.

Aulagnier S., Coquillard P. Dulphy J-P., Gueugnot J., 1991. L’avifaune nicheuse de la Narse de l’Espinasse (Puy de Dôme). Le grand Duc 37, 304(2).

Coquillard P., 1986.Traitement informatiques des données phytoécologiques et hiérarchisation des variables, application à une région érémique du Maroc : le Tafilalet. Bull. Inst. Sc. 10 :87-100, Rabat (Maroc).

COQUILLARD P., GUILLOT J. & GUEUGNOT J., 1985. - A propos de la dynamique des hêtraies de basse altitude sur le rebord oriental du plateau de la Chaîne des Puys. Exemple du bassin versant du Lac d'Aydat (Puy-de-Dôme). Rev. Sci. Nat. Auvergne, 51 : 9-23
 
S. MECHOUD, D. HILL, A. CAMPOS, D. ORTH, P. CARRERE, D. MICOL, C. POIX, Y. MICHELIN, P. COQUILLARD, B. DUMONT, 1998. " Simulation Multi-Agents de l'entretien du paysage par des herbivores en moyenne montagne", Actes de la Conférence SMAGET organisée par le CEMAGREF et l'ENGREF, pp. 65-78.

COQUILLARD P., HILL D., MAZEL C., GUEUGNOT J., 1997. "Application de l'analyse spectrale à l'étude de la répartition spatio-temporelle d'événements générés par simulation", Les Temps de l'Environnement, Journées CNRS du PIREVS, 5-7 novembre, Toulouse, pp. 455-463.

MAZEL C., HILL D., COQUILLARD P., 1997. "Interprétation des résultats de couplage de Systèmes d'Information Géographiques et d'outils de simulation discrète d'écosystèmes", Conférence Européenne sur l'Informatique pour l'Environnement, INRIA Ed., pp. 598-607.

COQUILLARD P. HILL D. GUEUGNOT J., 1995. "Simulation d'Ecosystèmes et Systèmes d'Informations Géographiques : une interactivité nécessaire", Acte de la conférence Nationale des Parcs Naturels de France, pp. 39-46, 18 Janvier, Ecole des Mines de St-Etienne.

COQUILLARD P., GUEUGNOT J. & MICHELIN Y., 1989. - Carte écologique du Massif du Sancy au 1/25000ème. Proposition méthodologique. Exemple du domaine sylvatique de l'étage montagnard. L'écologie en France. Des recherches aux applications : vers de nouvelles perspectives. Vème  Coll. National AFIE, Société d’Ecologie : 327-336

Coquillard P.,  Gueugnot J., Michalet R., 1988. Landes et herbages des édifices volcaniques de la Chaîne des Puys (Massif Central). II Ecologie et pastoralisme. XVI Coll. Int. Phyto., Versailles pp 366-387.

Coquillard P.,  Gueugnot J., Michalet R., 1988. Un paysage en danger : la chaîne volcanique des Puys (Massif Central), I. synsystématique. XVI. Coll Int. Phyto., Paris, 645-664.

Coquillard P., 1980. Etude des formations végétales et groupements du vallon de Laghet (A.M.) en vue de l’aménagement des abords de l’autoroute A8. Comité de Gestion des Ressources Renouvelables (DGRST), « structure, dynamique, utilisation des formations à chêne pubescent en zone bioclimatique méditerranéenne ». Réunion plénière de mai 1980, 7p., 2 cartes, 3 tab.  annexes.