Structure des biomolécules

A. Les 21 acides aminés naturels

Définitionun acide aminé

Un acide aminé est un composé chimique considéré comme la brique élémentaire des protéines. Ce composé comporte une fonction acide cabroxylique -COOH et une fonction amine -NH2.

Il existe 21 acides-aminés naturels. Leur différence tient à la nature de leur groupement chimique variable, appelé chaîne latérale (notée « R » dans la suite). Leur structure chimique se décrit comme dans le schéma suivant.

Définitionla chaîne latérale

la chaîne latérale d'un acide aminé est le groupement chimique porté par l'atome de carbone dit alpha (noté en bleu), comme indiqué sur le schéma :

L'atome de carbone alpha est un atome de carbone asymétrique. Les acides aminés naturels sont chiraux, et sont ultra-majoritairement de type L.

Selon la nature de la chaîne latérale, les acides-aminés possèdent des propriétés physico-chimiques différentes.

Les 21 acides aminés sont répertoriés par leur nom que l'on peut simplifier en codes à 3 lettres ou encore plus simplement en une seule lettre. Le tableau suivant regroupe les noms et les codes des acides aminés :

Acide aminé

Abréviation en 3 lettres

Abréviation en 1 lettre

Alanine

Ala

A

Arginine

Arg

R

Acide aspartique

Asp

D

Asparagine

Asn

N

Cystéine

Cys

C

Acide Glutamique

Glu

E

Glutamine

Gln

Q

Glycine

Gly

G

Histidine

His

H

Isoleucine

Ile

I

Leucine

Leu

L

Lysine

Lys

K

Méthionine

Met

M

Phenylalanine

Phe

F

Proline

Pro

P

Serine

Ser

S

Thréonine

Thr

T

Tryptophane

Trp

W

Tyrosine

Tyr

Y

Valine

Val

V

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